Nos activités
L’unité de bactériologie du CeDReS, dont le personnel constitué de biologistes, d’ingénieurs biologistes et de biotechnologistes intervient dans la recherche biomédicale, ainsi que dans le diagnostic des différentes pathologies ayant potentiellement une étiologie bactérienne. La réalisation de toutes ces activités est guidée par l’engagement à fournir aux cliniciens, et au bénéfice des patients, des prestations de qualité en vue d’améliorer leur prise en charge. Les activités de l’unité sont scindées en 3 groupes :
- Diagnostic médical
- Expertise médico-professionnelle
- Recherche biomédicale
Activités de diagnostic :
L’unité de bactériologie du CeDReS assure des activités de diagnostic couvrant tout le champ de la bactériologie classique.
Ainsi, sont analysés tous les produits biologiques humains à savoir les urines, les selles, le sang, les pus divers et liquides de ponction (liquide céphalorachidien, liquide pleural, péricardique, articulaire, … etc.) de même que les dispositifs intraveineux ou intra-urétraux (bouts de catéthers ou sonde urinaires).
Il est, à cet effet réalisé :
- L’examen cytologique
- L’isolement sur milieux spécifiques
- L’identification des bactéries en cause dans l’infection
- Les tests de sensibilité afin de définir les antibiotiques actifs sur les germes identifiés.
Activités d’expertise médico-professionnelle
Deux grands groupes d’activités sont réalisées.
- Recherche du portage de pathogènes bactériens
Dans le cadre de bilans d’embauche ou de suivi du personnel d’entreprises de restauration collective, l’unité de bactériologie effectue la recherche du portage de microorganismes pouvant être responsables de toxi-infections alimentaires collectives (TIAC). Il s’agit notamment de :
- Prélèvements nasopharyngés pour la recherche de Staphylococcus aureus dans les fosses nasales.
- Recueil de selles puis coproculture à la recherche de Salmonella spp. et de tout autre microorganisme entéropathogène.
- Prélèvement de gorge à la recherche de microorganismes responsables d’angines.
- Analyse de l’environnement des services hospitaliers
Tout sujet séjournant en milieu hospitalier est susceptible de contracter une infection liée aux soins qu’il reçoit et/ou à l’environnement, certains services étant plus à risque que d’autres.
Par ailleurs, ces germes dit nosocomiaux se caractérisent généralement par un niveau de résistance élévé aux antibiotiques.
Ainsi, sur sollicitation des services concernés, CeDReS effectue régulièrement des prélèvements de l’environnement et des surfaces en vue d’analyses bactériologiques. Celles-ci ont pour but d’identifier les germes présents et d’établir leur profil de résistance aux antimicrobiens.
Activités de recherche biomédicale
Nos activités de recherche portent principalement sur les thématiques suivantes :
- Evaluation de tests diagnostiques
- Suivi de la résistance bactérienne aux antibiotiques
- Diagnostic biologique des infections sexuellement transmissibles
CHEF D’UNITE
Pr OUASSA Timothée
Professeur de Bactériologie
L’unité de biochimie du CeDReS, à l’instar des autres unités réunit des biologistes et du personnel qualifié engagés dans les différents aspects des méthodes et des explorations biologiques concourant au diagnostic et au pronostic des pathologies locales et à la recherche biomédicale. Le personnel de l’unité de biochimie participe à toute action destinée à assurer la qualité des examens. Les activités de l’unité sont scindées en 3 groupes :
- Diagnostic et pronostic médical
- Expertise médico-professionnelle
- Recherche biomédicale
Activités de diagnostic et de pronostic :
L’unité de biochimie clinique du CeDReS assure des activités de diagnostiques dans différents champs de la pathologie médicale.
Grâce à des analyseurs intégrés à une chaîne robotisée, le dosage de plus de 100 analytes de routine d’intérêt médical est assuré en utilisant des méthodes analytiques telles que :
- la spectrocolorimétrie
- l’enzymocolorimétrie
- la turbidimétrie
- la potentiométrie
A partir de différents spécimens biologiques (sang, urines, liquide céphalorachidien, liquide pleural, péricardique, articulaire, … etc.) l’unité de biochimie du CeDReS explore l’intégrité physiologique et les fonctions de plusieurs organes et tissus :
- Exploration des fonctions hépatobiliaires
- Exploration des fonctions rénales et suivi des dialysés et transplantés
- Etude des dysprotéinémies (électrophorèses et dosage des protéines spécifiques)
- Exploration des processus inflammatoires
- Exploration du métabolisme du fer
- Exploration des dyslipoprotéinémies et des maladies cardio-vasculaires
- Exploration du métabolisme phospho-calcique et des pathologies osseuses
- Exploration des fonctions thyroïdiennes
- Exploration des fonctions cortico-surrénaliennes et médullo-surrénaliennes
- Exploration de la fertilité, de la reproduction et de la grossesse
- Exploration oncologique par des biomarqueurs tumoraux circulants
Activités d’expertise médico-professionnelle
La formation du personnel et les activités de l’unité lui confère une expertise dans différents domaines :
- validation de procédures d’analyse
- validation des trousses d’analyses
- Validation d’analyseurs
- Conseil sur protocole de recherche
- Conseil en instrumentation de laboratoire
- Formation en biologie clinique
Activités de recherche biomédicale
Nos thématiques de recherche portent sur les aspects biochimiques des pathologies tropicales (transmissibles et non transmissibles) aux fins de comprendre les facteurs déterminants les variations physiopathologiques et la morbi-mortalité des pathologies locales (paludisme, tuberculose, Sida/VIH, diabète sucré, hypertension artérielle, … etc.). Outre les biomarqueurs moléculaires, nous étudions leurs associations avec les facteurs physiologiques, ethno-génétiques, socio-économiques, anthropomorphiques, … etc.
Nos thématiques de recherche sont :
- Détermination des constantes biologiques des populations locales
- Suivi des essais cliniques
- Profil biochimique des pathologies infectieuses tropicales
- Profil biochimique des pathologies non transmissibles
- Biochimie des organismes infectieux
CHEF D’UNITE
Pr AHIBOH Hugues
Professeur de Biochimie
L’unité de biologie moléculaire (UBM) du CeDReS réunit des biologistes et du personnel qualifié engagés dans les différents aspects des méthodes et des explorations biologiques concourant au diagnostic et au pronostic des pathologies locales et à la recherche biomédicale. Chaque membre du personnel contribue à assurer la qualité des résultats des examens demandés. Nos activités sont de 3 types :
- Le diagnostic et suivi biologique d’infections
- L’expertise médico-professionnelle
- La recherche biomédicale
Activités de diagnostic et de suivi biologique :
L’UBM assure des activités de diagnostic moléculaire (ADN, ARN) pour diverses pathologies médicales telles que l’infection à VIH-1, à VIH-2, l’hépatite virale B, la COVID 19 et l’infection à papillomavirus (dépistage du cancer du col de l’utérus). L’unité réalise également des mesures de charge virale plasmatique pour les personnes vivant avec le VIH-1, le VIH-2 et l’hépatite virale B.
L’UBM dispose de systèmes intégrés combinant extracteurs à des machines de PCR et de systèmes individualisés ouverts. Les équipements d’extraction se composent :
– des extracteurs GenoXtract de Hain
– d’un extracteur KingFischer Flex de ThermoFischer
– des extracteurs Andis350 de 3DMed
– d’un Cobas Ampliprep de Roche
– d’un Cobas 480 x de Roche
Parmi les systèmes de PCR en temps réel, l’UBM dispose :
- D’un Quant Studio Dx5 de ThermoFischer
- De plusieurs Fluorocycler XT de Hain
- D’un Cobas Taqman 48 de Roche
- D’un Cobas 480 z de Roche
Au titre de la PCR classique, les appareils suivants sont disponibles :
- GeneAmp 2700 d’Applied Biosystems (ThermoFischer)
- GeneAmp 9600 d’Applied Biosystems (ThermoFischer)
- Chaine d’électrophorèse sur gel d’agarose
- Transilluniteur à UV
L’unité réalise les examens susmentionnés à partir de différents spécimens biologiques (sang, DBS, écouvillon nasopharyngé, prélèvement cervico-vaginal… etc.). Parmi les analyses offertes, les examens suivants sont retrouvés :
- Le diagnostic pédiatrique précoce du VIH-1 (bébé de 6 à 18 mois nés de mères infectées par le VIH-1)
- Le diagnostic pédiatrique précoce du VIH-2 (bébé de 6 à 18 mois nés de mères infectées par le VIH-2)
- Le diagnostic moléculaire de la COVID (écouvillon nasopharyngé de cas suspects et de voyageurs)
- Le diagnostic et le typage moléculaires de l’infection à papillomavirus (frottis cervico-vaginal pour le dépistage du cancer du col de l’utérus chez la femme)
- La mesure de la charge virale plasmatique VIH-1 (vérification de l’efficacité du traitement antirétroviral chez les PVVIH-1)
- La mesure de la charge virale plasmatique VIH-2 (vérification de l’efficacité du traitement antirétroviral chez les PVVIH-2)
- La mesure de la charge virale plasmatique VHB (bilan initial et de suivi d’hépatite virale B)
Activités d’expertise médico-professionnelle
La formation du personnel et les activités de l’unité lui confère une expertise dans différents domaines :
- validation de procédures d’analyse
- validation des trousses d’analyses
- Validation d’analyseurs
- Conseil sur protocole de recherche
- Conseil en instrumentation de laboratoire
- Formation en biologie clinique
Activités de recherche biomédicale
Nos thématiques de recherche portent sur les aspects moléculaires des pathologies tropicales (transmissibles et non transmissibles) aux fins de comprendre les facteurs déterminants les variations physiopathologiques et la morbi-mortalité des pathologies locales (Sida/VIH, hépatite virale B, SARS-CoV 2, cancer du col de l’utérus, … etc.). Nous étudions l’association de biomarqueurs moléculaires avec les facteurs physiologiques, ethno-génétiques, socio-économiques, anthropomorphiques, … etc. En outre, l’UBM dispose d’un mini-séquenceur MinION d’Oxford Nanopore Technology pour des études genotypiques chez l’homme et les microbes. Nos thématiques de recherche sont :
- Le suivi des essais cliniques
- La caractérisation moléculaire des pathologies infectieuses tropicales
- L’évaluation de marqueurs diagnostiques et pronostiques de pathologies non transmissibles
- Le genotypage d’organismes infectieux
- Génétique des populations humaines dans divers domaines : immunologie, cardiologie, cancérologie, apolipoprotéines, endocrinologie
CHEF D’UNITE
Pr AHIBOH Hugues
Professeur de Biochimie
En cours
En cours
En cours
En cours
CHEF D’UNITE
Pr INWOLEY André
Professeur d’Immunologie
ACTIVITES
L’unité d’immunologie réalise trois types d’activités :
- Une activité de diagnostic et monitoring des sujets atteints de maladies infectieuses notamment : Infection à VIH, Hépatites virales B et C, Tuberculose, Toxoplasmose, Rubéole, Tréponématoses.
- Une activité de recherche dont les principaux axes sont :
a-Développement et évaluation de tests de diagnostic indirect des maladies infectieuses (VIH, Hépatites, Tuberculose, etc.)
b-Essai vaccinal ou de sérothérapie de maladies infectieuses
c-Evaluation des biomarqueurs de l’inflammation
d-Etude des marqueurs phénotypiques des cellules du système immunitaire
- La formation de base ou spécialisée de personnel de laboratoire
CHEF D’UNITE
Pr INWOLEY André
Professeur d’Immunologie
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En cours
En cours
En cours
En cours
CHEF D’UNITE
Pr OUASSA Timothée
Professeur de Mycobactériologie
AXES DE RECHERCHE
- Épidémiologie des mycoses superficielles et profondes et sensibilité aux antifongiques
Ou
Epidémiologie et émergence de la résistance chez les champignons pathogènes (infections fongiques superficielles ou profondes)
- Épidémiologie/Diagnostic moléculaire des affections opportunistes au cours du sida.
- Surveillance de l’efficacité thérapeutique des combinaisons thérapeutiques à base de dérivés d’artémisinine et prise en charge du paludisme en Côte d’Ivoire
- Épidémiologie des autres affections parasitaires et mycosiques
UN MOT SUR L’UNITE DE PARASITOLOGIE MYCOLOGIE
L’unité de parasitologie a pour mission première le diagnostic et le suivi des infections dues à des parasites et champignons microscopiques. Son activité de biologie médicale, qui s’appuie sur la démarche qualité, lui permet d’interagir fortement avec plusieurs disciplines cliniques pour lesquelles son expertise est indispensable : maladies infectieuses …
Ses approches diagnostiques reposent globalement sur un ensemble de techniques microscopiques, sérologiques, de détections d’antigènes, et très prochainement de biologie moléculaire et de spectrométrie de masse en collaboration avec les autres unités du service et instituts de recherches partenaires.
ACTIVITES
L’unité de parasitologie et mycologie réalise deux type d’activités :
- Une activité de laboratoire, dédiée au diagnostic biologique des parasitoses (helminthoses intestinales, paludisme…) ainsi qu’au mycoses bénignes (dermatophytoses, pityriasis…) ou malignes rencontrées chez les patients immunodéprimés (septicémie à Candida, cryptococcose, aspergilloses invasives,…)
- Diverses actions d’expertises en parasitologie et mycologie sont menées par tous les membres du service :
a- Renforcement des compétences des prestataires de soins (médecins, pharmaciens, infirmiers et sages-femmes) sur les principales stratégies de lutte contre le paludisme, le diagnostic, la prise en charge, la prévention et la notification des cas de paludisme.
b- Formation des bio technologistes à la microscopie (Paludisme).
c- Evaluation d’activité d’antifongiques de diverses substances naturelles et de synthèse.
d- Exécution de divers projets de recherche pour le compte du Programme National de Lutte contre le Paludisme (PNLP) ou de structure privées
e- Evaluation des performances des tests de diagnostic rapide du paludisme avant l’autorisation de commercialisation et en situation réelle d’utilisation en Côte d’Ivoire.
IMPLICATION DANS LA FORMATION INITIALE ET CONTINUE
- Etudiants en Pharmacie, médecine et d’autres structures de formation de diverses universités nationales et internationales
- Etudiants en
- Biotechnologiste en formation à l’INFAS
- Etudiants de grandes écoles privées
RESSOURCES HUMAINES
Responsable : Pr KASSI Fulgence
Biologiste : Dr KONE Dignanyo Estelle
Ingénieur : Mr TOURE Clébien Patrice
Technicien : Mr KOUAME Konan
CHEF D’UNITE
Pr KASSI Fulgence
Professeur de Parasitologie-Mycologie